Alionių seniūnija yra Rytų Lietuvoje, Širvintų rajono savivaldybėje, Vilniaus apskrityje. Administracinis centras ir didžiausia gyvenvietė – Alionių I-asis kaimas. Gyventojų skaičius – apie 700.
Alionių seniūnija yra Vakarų Aukštaičių plynaukštėje, tad kraštovaizdis čia banguotas. Yra neaukštų kalvų, kurias keičia pelkėtos daubos. Didžiausioje jų plyti didžiulė Alionių pelkė, saugoma to paties pavadinimo telmologiniame draustinyje. Didelę dalį ploto užima ir miškai, nemažai jų yra pelkėti. Seniūnijoje teka nemažai upių: Širvinta, Juodė, Musė ir kt. Didžiausias ežeras – pelkės supamas Alys.
Seniūnijoje nėra magistralinių ar krašto kelių, geležinkelių. Ją kerta keli rajoniniai keliai: 4307, 4314, 4302, 4318. Palyginti netoli yra Vilniaus miestas, tad geografinė padėtis nebloga. Seniūnija pasižymi natūralia ir pusiau natūralia, vertinga gamta.