Batakių seniūnija yra Vakarų Lietuvoje, Tauragės rajono savivaldybėje, Tauragės apskrityje. Administracinis centras – Batakių miestelis, didžiausia gyvenvietė – Eidintų kaimas. Gyventojų skaičius – apie 1100.
Seniūnija yra Karšuvos žemumoje, netoli Žemaičių aukštumos tad kraštovaizdis lygus arba banguotas. Paviršių paįvairina tik Ančios, Šešuvio ir kitų upių slėniai. Didesnių ežerų nėra. Miškų daugiausiai vakarinėje ir šiaurinėje dalyse, likusioje seniūnijos dalyje vyrauja žemės ūkio naudmenos.
Seniūniją šiaurės vakarinėje dalyje kerta magistralinis kelias A12, jungiantis Šiaulius ir Tauragę (tai Rygos-Karaliaučiaus kelio dalis). Per seniūniją eina geležinkelio linija tarp Radviliškio ir Pagėgių, šiuo metu naudojama tik krovinių gabenimui. Per pastaruosius du dešimtmečius Batakių seniūnija neteko maždaug trečdalio gyventojų.