Eišiškių seniūnija yra Pietryčių Lietuvoje, Šalčininkų rajono savivaldybėje, Vilniaus apskrityje. Ribojasi su Baltarusija. Administracinis centras ir didžiausia gyvenvietė – Eišiškių miestas. Gyventojų skaičius – apie 3 800.
Eišiškių seniūnija yra Eišiškių plynaukštėje, kur vyrauja banguotas kraštovaizdis. Vakarinė dalis patenka į Versekos dubumą, susiformavusią aplinkui čia tekančią Versekos upę. Yra keletas tvenkinių. Miškų mažai, tik nedideli jų plotai išsibarstę tolygiai seniūnijos teritorijoje, vyrauja žemės ūkio naudmenos.
Seniūnijoje yra du krašto keliai: KK105, jungiantis Eišiškes ir Pirčiupius, ir KK126, jungiantis Eišiškes ir Šalčininkus. Kaip ir būdinga visai Šalčininkų rajono savivaldybei, didžioji dalis seniūnijos gyventojų yra lenkų tautybės. Dėl savo atokumo seniūnijos demografinė padėtis sudėtinga – per pastaruosius dešimtmečius gyventojų skaičius sparčiai mažėjo.